Odděl si adresáře. Aktivní budou Routes, Global eventuelně Sound, pokud některé tratě mají odchylné a nekompatibilní tratě které nebudu jezdit dám do adresářů RoutesBP, RoutesX, GlobalBP, GlobalX, Global321. Pak jednoduše, když budu chtít jezdit jinou trať např. 321, tak nejprve aktivní Routes a Global přejmenuji na nějaký svůj index a poté přejmenuji Global321 na Global a to samé například RoutesX na Routes. Eventuelně je nutné reinstalovat MSTS BIN, kdyby to náhodou padalo. Já takhle funguji celé roky a žádný problém. Navíc mám vše v jednou adresáři Train Simulator, takže pokud si tohle zálohuji mám takto pohromadě kompletní MSTS se všemi tratěmi a vlaky a mohu si to z externího disku jednoduše přenášet na jiné počítače.
Samozřejmě jsou i jiné blbuvzdornější metody, ale znalý inteligentní uživatel by neměl mít žádný problém.